Esta nueva construcción optimiza el uso de energía, iluminación y consumo de agua. Además, incorpora materiales ecológicos y reutilizados a la construcción. Una de las características más impactantes es que el Aeropuerto Ecológico Galápagos funciona al 100% con energía renovable (solar y eólica), que sale en un 35% de paneles fotovoltaicos ubicados en las caminerías de la terminal. El 65% restante es generado por molinos eólicos estratégicamente ubicados en la zona adjunta al aeropuerto. Este parque eólico fue realizado por el gobierno de Ecuador.
Gran parte de las piezas y muebles del aeropuerto tienen certificación ambiental en madera y fueron hechas con materiales de fuentes responsables. En cuanto a su elaboración, la misma es sostenible y amigable con el medio ambiente. Además, el aeropuerto cuenta con una planta desalinizadora propia. En ella, el agua desalinizada ingresa en la terminal y una vez que se usa, se recolecta, se le da tratamiento y se la recicla, para evitar generar agua residual al mismo tiempo que se ahorra agua. Prácticamente toda el agua se recupera, se trata y se reutiliza para evitar todo tipo de desecho de este importante recurso.
Tanto la ventilación como la estructura del aeropuerto están calculadas para aprovechar la energía y el potencial de la naturaleza, al mismo tiempo que cumplen con los requisitos internacionales en materia de seguridad.
. El Aeropuerto Ecológico Galápagos es una razón más para conocer la vasta riqueza que ofrece la Isla, sus playas de aguas cristalinas, su gente y su belleza natural.
El aeropuerto Seymour expone la creciente demanda a nivel mundial de incorporar criterios de sustentabilidad en nuevos proyectos y evaluar aspectos específicos que permitan reducir los impactos ambientales del hábitat construido y proteger el hábitat natural, particularmente en sitios sensibles y de alto valor patrimonial como es el caso de las islas Galápagos. Fue pensado, diseñado y construido en su totalidad como una edificación sustentable, con el objetivo de convertirse en lo que ya es: el Primer Aeropuerto Ecológico del Mundo. 
